Pues todo lo que me dices me suena a una concatenación de cosas.
En primer lugar le cambiasteis la comida de forma drástica, lo que le provocó la primera diarrea casi con total seguridad. Después el desparasitador, si tenía gusanetes, lo que es bastante probable,le provocó la segunda diarrea. Probablemente, si le duró una semana, estaría un poco más deshidratada de lo normal y eso pudo provocarle a su vez la cistitis.
Lo primero es que si la gatuna está con diarrea es asegurarse que bebe agua suficiente, incluso forzándola con una jeringuilla. Si veis que no bebe o la vomita, al veterinario a que le pongan suero en una vía o lo que sea, porque sino no se le va a curar la cistitis. Lo segundo, y por la edad que tiene, dos meses, ¿qué alimentación le estás dando?
Por los antibióticos no te preocupes que aunque sea pequeña le darán la dosis que ella pueda admitir.
Por último, si no te convence tu veterinario o el tratamiento que le está dando, pide una segunda opinión, que nunca está de más.
Mucha suerte con la michina.
